Show simple item record

Thai Liver and Bile Duct Cancer Organoid Bank and Comprehensive Genetic/Drug Response Database for Biomarkers Discovery and Development of Personalized Treatment

dc.contributor.authorนิพัญจน์ อิศรเสนา ณ อยุธยาth_TH
dc.contributor.authorNipan Israsena Na Ayudhayath_TH
dc.contributor.authorพิสิฐ ตั้งกิจวานิชย์th_TH
dc.contributor.authorPisit Tangkijvanichth_TH
dc.contributor.authorสิระ ศรีสวัสดิ์th_TH
dc.contributor.authorSira Sriswasdith_TH
dc.contributor.authorแพรวพรรณ อิงรุ่งเรืองเลิศth_TH
dc.contributor.authorPraewphan Ingrungruanglertth_TH
dc.date.accessioned2022-09-16T09:00:18Z
dc.date.available2022-09-16T09:00:18Z
dc.date.issued2565-04
dc.identifier.otherhs2879
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11228/5734
dc.description.abstractมะเร็งตับเป็นปัญหาสำคัญของประเทศ การรักษาปัจจุบันยังได้ผลไม่ดีเท่าที่ควร ทำให้มีผู้ป่วยจำนวนมากเสียชีวิตจากโรคนี้ เมื่อไม่นานมานี้เกิดเทคโนโลยีใหม่ทำให้สามารถเพาะมะเร็งตับของผู้ป่วยในรูปแบบสามมิติที่เรียกว่าออกานอยด์ ซึ่งพบว่า ออกานอยด์มีข้อดีกว่า cell line ของมะเร็งที่ใช้ในการพัฒนายาอยู่เดิม เนื่องจากสามารถคงความหลากหลายทางพันธุกรรมของผู้ป่วยแต่ละคนไว้ได้และมีการตอบสนองต่อยาใกล้เคียงกับที่พบในผู้ป่วยจริงมากกว่า มีโอกาสนำมาใช้คัดเลือกการรักษาที่เหมาะสมต่อผู้ป่วยจำเพาะราย การเก็บรวบรวมออกานอยด์สร้างเป็น biobank การเก็บข้อมูลทางคลินิกของผู้ป่วย ร่วมกับการศึกษาทางพันธุกรรมเชิงลึกที่มากพอ จะสามารถนำไปสู่การหา biomarker สำหรับใช้ในการเลือกแนวทางการรักษาที่เหมาะของผู้ป่วยไทยและเป็นเครื่องมือสำคัญในการใช้พัฒนายาใหม่ที่มีประสิทธิภาพแตกต่างจากที่มีในอดีต โครงการนี้ประสบความสำเร็จในการสร้าง liver cancer organoids รวมทั้ง normal liver organoid จากผู้ป่วยรายเดียวกันรวม 30 ราย พร้อมข้อมูลการศึกษาทางพันธุกรรมเชิงลึกประกอบด้วยข้อมูล whole exome sequencing, whole transcriptomics study และข้อมูล heterogeneity ในแต่ละ organoid line ที่ระดับ single cell ตลอดจนลักษณะการตอบสนองต่อยามะเร็งหลายชนิด ซึ่งจากการวิเคราะห์ พบว่าใน Cholangiocarcinoma organoid ของผู้ป่วยแต่ละรายจะมีการตอบสนองต่อยามะเร็งแตกต่างกัน แสดงให้เห็นถึงความเป็นไปได้ที่จะพัฒนาวิธีการเลือกยามะเร็งให้เหมาะสมในผู้ป่วยแต่ละรายโดยใช้ออกานอยด์ร่วมกับข้อมูลทางพันธุกรรมเชิงลึก นอกจากนี้จากข้อมูลที่ทำการศึกษาทำให้ได้ candidate biomarkers และยาที่มีศักยภาพที่จะพัฒนาไปใช้ในการรักษา Cholangiocarcinoma (CCA) เพิ่มจากที่มีอยู่ในปัจจุบัน สำหรับ Hepatocellular carcinoma (HCC) จากการศึกษาข้อมูลทางพันธุกรรมเชิงลึก พบว่ามี heterogeneity ระหว่างผู้ป่วยสูงมากและการตอบสนองต่อยาที่ใช้เป็น standard treatment ที่ไม่ดี แต่จากการวิเคราะห์เชิงลึกทำให้พบ new subpopulation ของ HCC ที่มีลักษณะจำเพาะ มีความเป็น stemness สูง และมีคุณสมบัติในการตอบสนองต่อยาที่แตกต่างจากเซลล์มะเร็ง HCC กลุ่มอื่นซึ่งอาจพัฒนาเป็นแนวทางการรักษาใหม่ได้ โดยรวมโครงการได้สร้างฐานข้อมูลและเครื่องมือสำคัญที่จะเป็นประโยชน์ในการพัฒนาวิธีการรักษามะเร็งตับของประเทศต่อไปth_TH
dc.description.sponsorshipสถาบันวิจัยระบบสาธารณสุขth_TH
dc.language.isothth_TH
dc.publisherสถาบันวิจัยระบบสาธารณสุขth_TH
dc.rightsสถาบันวิจัยระบบสาธารณสุขth_TH
dc.subjectมะเร็งth_TH
dc.subjectCancerth_TH
dc.subjectมะเร็งตับth_TH
dc.subjectLiver--Cancerth_TH
dc.subjectOrganoidsth_TH
dc.subjectพันธุศาสตร์มนุษย์th_TH
dc.subjectHuman Geneticsth_TH
dc.subjectยีนth_TH
dc.subjectGeneth_TH
dc.subjectพันธุกรรมth_TH
dc.subjectGeneticsth_TH
dc.subjectจีโนมมนุษย์th_TH
dc.subjectHuman Genometh_TH
dc.subjectGenomicsth_TH
dc.subjectPrecision Medicineth_TH
dc.subjectระบบบริการสุขภาพth_TH
dc.subjectHealth Service Systemth_TH
dc.subjectระบบบริการสาธารณสุขth_TH
dc.subjectHealth Care Systemth_TH
dc.subjectระบบสารสนเทศด้านสุขภาพ (Health Information Systems)th_TH
dc.subjectภาวะผู้นำและการอภิบาล (Leadership and Governance)th_TH
dc.subjectมะเร็งท่อน้ำดีth_TH
dc.subjectCholangiocarcinomath_TH
dc.subjectCarcinoma, Hepatocellularth_TH
dc.titleธนาคารออกานอยด์มะเร็งตับและท่อน้ำดีไทย และฐานข้อมูลพันธุกรรมเชิงลึกสำหรับการหาตัวชี้วัดชีวภาพและพัฒนาการรักษาแบบจำเพาะต่อผู้ป่วยth_TH
dc.title.alternativeThai Liver and Bile Duct Cancer Organoid Bank and Comprehensive Genetic/Drug Response Database for Biomarkers Discovery and Development of Personalized Treatmentth_TH
dc.typeTechnical Reportth_TH
dc.description.abstractalternativePrimary liver cancers, including both hepatocellular carcinoma (HCC) and cholangiocarcinoma (CCA), is an important cause of cancer-related deaths in Thailand and worldwide due to ineffectiveness of current available treatments. The recently developed organoid technology, which allows long-term culture of patient-derived liver cancer cells in 3D while maintaining morphology, expression pattern, and the genetic heterogeneity of the original tumors, has been shown to be powerful research tool for the discovery of biomarkers and therapeutic drugs for various cancers. In this study we successfully established 31 cancer organoids line from Thai patients with CCA and HCC, and characterized in detail these organoids with whole exome sequencing, whole transcriptomics study, single-cell RNA sequencing and pharmacophenotyping with various anticancer drugs. Our data shows patient specific response in CCA organoids and supports the usage of personalized treatment strategy for CCA. Moreover, we identified new potential biomarkers and novel compounds that can be applied to CCA management. One of the candidates for CCA drugs showed promising result in 3/3 PDX models tested. For HCC, although there is high heterogeneity among patients’ sample and limited drug response to standard drugs used in HCC management, we identified new subpopulation of HCC with high stemness, unique immunogenic profiles, and treatment response which may become interesting candidate for developing new treatment option for HCC. Overall, we successfully generate database and important tools for future development of new treatment for Thai patient with liver cancer.th_TH
dc.identifier.callnoQZ200 น618ธ 2565
dc.identifier.contactno63-115
dc.subject.keywordฐานข้อมูลพันธุกรรมth_TH
dc.subject.keywordข้อมูลพันธุกรรมth_TH
dc.subject.keywordGenetic Informationth_TH
dc.subject.keywordการแพทย์แม่นยำth_TH
dc.subject.keywordการรักษาอย่างแม่นยำth_TH
dc.subject.keywordการรักษาแบบแม่นยำth_TH
dc.subject.keywordDNA Sequencingth_TH
dc.subject.keywordGenetic Diseasesth_TH
dc.subject.keywordGenomics Medicineth_TH
.custom.citationนิพัญจน์ อิศรเสนา ณ อยุธยา, Nipan Israsena Na Ayudhaya, พิสิฐ ตั้งกิจวานิชย์, Pisit Tangkijvanich, สิระ ศรีสวัสดิ์, Sira Sriswasdi, แพรวพรรณ อิงรุ่งเรืองเลิศ and Praewphan Ingrungruanglert. "ธนาคารออกานอยด์มะเร็งตับและท่อน้ำดีไทย และฐานข้อมูลพันธุกรรมเชิงลึกสำหรับการหาตัวชี้วัดชีวภาพและพัฒนาการรักษาแบบจำเพาะต่อผู้ป่วย." 2565. <a href="http://hdl.handle.net/11228/5734">http://hdl.handle.net/11228/5734</a>.
.custom.total_download3
.custom.downloaded_today0
.custom.downloaded_this_month0
.custom.downloaded_this_year3
.custom.downloaded_fiscal_year0

Fulltext
Icon
Name: hs2879.pdf
Size: 17.53Mb
Format: PDF
 

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record